Al in 1967 werd Jan directeur van de Koningin Wilhelminaschool, toen directeur Dijkshoorn vlak voor de zomervakantie plotseling overleed. Jan was toen al adjunct directeur. Hij moest diploma’s uitreiken en het volgende schooljaar starten. De directeur en de adjunct directeur gaven naast de leiding aan de school ook les. Een adjunct directeur had extra taken naast het lesgeven, maar kreeg niet extra betaald. In die tijd stond er ook een lagere school (hervormd) aan de Onderweg, waarvan bovenmeester Krins eveneens op de Klokkenberg had gezeten.
De school groeit uit zijn voegen
Door de snelle groei van het aantal leerlingen zat de Koningin Wilhelminaschool op een gegeven moment op wel 13 locaties in Waddinxveen, zoals o.a. in het Ketelhuis in de Oranjewijk (nu moskee) , een uitbouw van het oude gemeentehuis aan de Gouwe, noodgebouwen achter de Mauritslaan tegen de dijk en noodgebouwen in de Mozartlaan, ongeveer waar nu het medisch centrum is. De leerlingen pendelden heen en weer en soms ook de leraren, wat erg veel tijd kostte. In 1976 werd de Koningin Wilhelminaschool een scholengemeenschap: naast de mavo kwam er ook een lto afdeling; Jan vond dat er in zo’n groot dorp ook een beroepsopleiding nodig was. Een nieuw gebouw was zeer gewenst om alle dependances te kunnen sluiten , wat later tot stand kwam aan de Sniepweg (nu Oude Dreef genaamd).
Nieuwbouw
Het Nederlands Hervormd onderwijs en het Chr. Nationaal onderwijs in Waddinxveen hadden eigenlijk allebei een eigen mulo gewild, maar burgemeester Van der Hooft bepaalde dat ze moesten samenwerken; er moest dus 1 christelijke mulo komen. Er werd een stichting voor christelijk Mavo te Waddinxveen opgericht. De bouwplannen waren in het midden van de jaren zeventig zover gevorderd, dat de Rijksgebouwendienst zijn goedkeuring verleende tot de bouw van een nieuwe mavoschool[1]. Door de stichting van de scholengemeenschap, bestaande uit mavo plus lts, liepen de bouwplannen echter vertraging op. Het ministerie wilde alleen een gebouw voor beide typen onderwijs. De nieuwe school werd gebouwd in 2 fases. Jan Willemstein legde de eerste steen (nu in bezit van het HGW) en eind 1978 werd de eerste fase van de school opgeleverd. Hierin kwamen praktijklokalen voor de technische vakken. In de daarna gebouwde tweede fase kwamen theorielokalen. Op 8 februari 1980 werd de opening verricht door burgemeester Smallenbroek. Dit gebouw werd later onderdeel van het Coenecoopcollege en is nu zelfs het enige gebouw van het huidige Coenecoopcollege.